Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VAMP3Q15836 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP3Q15836 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP3Q15836 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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