Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB30Q15771 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB30Q15771 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB30Q15771 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
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RAB30Q15771 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB30Q15771 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
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