Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGN3Q15651 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGN3Q15651 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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