Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNHIT3Q15649 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNHIT3Q15649 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms