Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDSNQ15517 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDSNQ15517 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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