Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TTF1Q15361 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TTF1Q15361 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TTF1Q15361 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTF1Q15361 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTF1Q15361 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTF1Q15361 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTF1Q15361 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTF1Q15361 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTF1Q15361 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTF1Q15361 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTF1Q15361 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTF1Q15361 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TTF1Q15361 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
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