Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC41Q15345 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC41Q15345 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC41Q15345 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms