Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD3Q15054 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD3Q15054 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLD3Q15054 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLD3Q15054 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLD3Q15054 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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