Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX17Q15036 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX17Q15036 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX17Q15036 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX17Q15036 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
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