Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERPUD1Q15011 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERPUD1Q15011 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD1Q15011 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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