Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PSMD6Q15008 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PSMD6Q15008 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMD6Q15008 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD6Q15008 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PSMD6Q15008 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD6Q15008 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD6Q15008 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD6Q15008 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD6Q15008 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD6Q15008 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD6Q15008 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD6Q15008 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD6Q15008 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD6Q15008 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD6Q15008 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms