Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NFIXQ14938 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NFIXQ14938 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NFIXQ14938 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NFIXQ14938 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFIXQ14938 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
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