Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SCARF1Q14162 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCARF1Q14162 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCARF1Q14162 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCARF1Q14162 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
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