Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIDRQ14159 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPIDRQ14159 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPIDRQ14159 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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