Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE7AQ13946 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE7AQ13946 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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