Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PKP1Q13835 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKP1Q13835 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKP1Q13835 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKP1Q13835 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
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