Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOFQ13790 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOFQ13790 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOFQ13790 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOFQ13790 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOFQ13790 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOFQ13790 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOFQ13790 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOFQ13790 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOFQ13790 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOFQ13790 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOFQ13790 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOFQ13790 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOFQ13790 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOFQ13790 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOFQ13790 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOFQ13790 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOFQ13790 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOFQ13790 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOFQ13790 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOFQ13790 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOFQ13790 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOFQ13790 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOFQ13790 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOFQ13790 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOFQ13790 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOFQ13790 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOFQ13790 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOFQ13790 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOFQ13790 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOFQ13790 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOFQ13790 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOFQ13790 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOFQ13790 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOFQ13790 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOFQ13790 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOFQ13790 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOFQ13790 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOFQ13790 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOFQ13790 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOFQ13790 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOFQ13790 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOFQ13790 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOFQ13790 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOFQ13790 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOFQ13790 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOFQ13790 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOFQ13790 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOFQ13790 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOFQ13790 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOFQ13790 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOFQ13790 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOFQ13790 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOFQ13790 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
APOFQ13790 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOFQ13790 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOFQ13790 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOFQ13790 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOFQ13790 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOFQ13790 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOFQ13790 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOFQ13790 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOFQ13790 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOFQ13790 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOFQ13790 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOFQ13790 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOFQ13790 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOFQ13790 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOFQ13790 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOFQ13790 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOFQ13790 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOFQ13790 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOFQ13790 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOFQ13790 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOFQ13790 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOFQ13790 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOFQ13790 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOFQ13790 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOFQ13790 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOFQ13790 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOFQ13790 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOFQ13790 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOFQ13790 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOFQ13790 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOFQ13790 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOFQ13790 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOFQ13790 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOFQ13790 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOFQ13790 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOFQ13790 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOFQ13790 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOFQ13790 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOFQ13790 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOFQ13790 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOFQ13790 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOFQ13790 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOFQ13790 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOFQ13790 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOFQ13790 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOFQ13790 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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