Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX6Q13608 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PEX6Q13608 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PEX6Q13608 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PEX6Q13608 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
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