Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA1Q13131 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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