Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRPL28Q13084 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL28Q13084 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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