Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKRN3Q13064 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MKRN3Q13064 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKRN3Q13064 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
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