Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PRDM2Q13029 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PRDM2Q13029 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
PRDM2Q13029 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
PRDM2Q13029 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PRDM2Q13029 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PRDM2Q13029 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
PRDM2Q13029 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
PRDM2Q13029 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
PRDM2Q13029 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
PRDM2Q13029 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
PRDM2Q13029 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
PRDM2Q13029 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
PRDM2Q13029 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC42.49■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC42.47■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
PRDM2Q13029 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC42.38■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
PRDM2Q13029 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.33■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.33■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
PRDM2Q13029 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC42.31■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PRDM2Q13029 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
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