Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 VPS4YPR173C 1314 nt6.17□□□□□ -1.42
MSH5Q12175 HIS7YBR248C 1659 nt6.17□□□□□ -1.42
MSH5Q12175 NUP53YMR153W 1428 nt6.16□□□□□ -1.42
MSH5Q12175 YIL077CYIL077C 963 nt6.16□□□□□ -1.42
MSH5Q12175 COA1YIL157C 594 nt6.16□□□□□ -1.42
MSH5Q12175 PEX3YDR329C 1326 nt6.16□□□□□ -1.42
MSH5Q12175 MPE1YKL059C 1326 nt6.16□□□□□ -1.42
MSH5Q12175 SKN1YGR143W 2316 nt6.16□□□□□ -1.42
MSH5Q12175 FMP40YPL222W 2067 nt6.15□□□□□ -1.42
MSH5Q12175 MRPS28YDR337W 861 nt6.15□□□□□ -1.42
MSH5Q12175 KSH1YNL024C-A 219 nt6.15□□□□□ -1.42
MSH5Q12175 MRS1YIR021W 1092 nt6.14□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 YEL020CYEL020C 1683 nt6.14□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 HXT17YNR072W 1695 nt6.14□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 RPL7AYGL076C 735 nt6.13□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 YML083CYML083C 1257 nt6.13□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 RPL7BYPL198W 735 nt6.13□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 YPQ2YDR352W 954 nt6.12□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 GPA2YER020W 1350 nt6.12□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 KEX2YNL238W 2445 nt6.12□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 MKK2YPL140C 1521 nt6.12□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 NHP6BYBR089C-A 300 nt6.12□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 LDB19YOR322C 2457 nt6.11□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 PLB2YMR006C 2121 nt6.11□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 GDH1YOR375C 1365 nt6.11□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 TUB1YML085C 1344 nt6.11□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 NTG2YOL043C 1143 nt6.11□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 YDR278CYDR278C 318 nt6.1□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 ADE1YAR015W 921 nt6.1□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 CIT3YPR001W 1461 nt6.09□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 YDR476CYDR476C 675 nt6.09□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 QCR8YJL166W 285 nt6.09□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 TMA46YOR091W 1038 nt6.09□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 YFR006WYFR006W 1608 nt6.09□□□□□ -1.43
MSH5Q12175 YMR279CYMR279C 1623 nt6.08□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 PGK1YCR012W 1251 nt6.08□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 SHO1YER118C 1104 nt6.08□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 DOC1YGL240W 753 nt6.08□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 FZF1YGL254W 900 nt6.08□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 COQ1YBR003W 1422 nt6.08□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 RIX7YLL034C 2514 nt6.07□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 HSP104YLL026W 2727 nt6.07□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 YIR042CYIR042C 711 nt6.06□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 RFC4YOL094C 972 nt6.06□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 SLG1YOR008C 1137 nt6.06□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 ATP4YPL078C 735 nt6.06□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 SMX3YPR182W 261 nt6.06□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 TNA1YGR260W 1605 nt6.06□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 VPS70YJR126C 2436 nt6.06□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 HED1YDR014W-A 489 nt6.05□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 AGX1YFL030W 1158 nt6.05□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 GET4YOR164C 939 nt6.05□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 YBR226CYBR226C 411 nt6.05□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 ATF1YOR377W 1578 nt6.05□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 CNE1YAL058W 1509 nt6.04□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 YJR146WYJR146W 354 nt6.04□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 IES2YNL215W 963 nt6.04□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 YPR130CYPR130C 408 nt6.04□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 CLB1YGR108W 1416 nt6.04□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 SFB3YHR098C 2790 nt6.04□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 RHO4YKR055W 876 nt6.03□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 OGG1YML060W 1131 nt6.03□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 YOL163WYOL163W 510 nt6.03□□□□□ -1.44
MSH5Q12175 DML1YMR211W 1428 nt6.02□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 YGL102CYGL102C 429 nt6.02□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 YNR005CYNR005C 405 nt6.02□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 VMA4YOR332W 702 nt6.02□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 SEC62YPL094C 825 nt6.02□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 MNN5YJL186W 1761 nt6.01□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 NSE5YML023C 1671 nt6.01□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 MRP1YDR347W 966 nt6□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 PRI1YIR008C 1230 nt6□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 YKL223WYKL223W 333 nt6□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 RPL21AYBR191W 483 nt6□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 COX10YPL172C 1389 nt6□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 POX1YGL205W 2247 nt5.99□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 GPB2YAL056W 2643 nt5.99□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 YIR007WYIR007W 2295 nt5.99□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 SCT1YBL011W 2280 nt5.99□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 KTR1YOR099W 1182 nt5.99□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 YBR124WYBR124W 360 nt5.99□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 HRQ1YDR291W 3234 nt5.99□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 CDC16YKL022C 2523 nt5.99□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 EPS1YIL005W 2106 nt5.99□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 XBP1YIL101C 1944 nt5.99□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 PCS60YBR222C 1632 nt5.99□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 TEP1YNL128W 1305 nt5.99□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 YGR054WYGR054W 1929 nt5.98□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 CIA1YDR267C 993 nt5.98□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 CWC21YDR482C 408 nt5.98□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 RPE1YJL121C 717 nt5.98□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 DID2YKR035W-A 615 nt5.98□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 SCO2YBR024W 906 nt5.98□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 NME1NME1 340 nt5.98□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 PET112YBL080C 1626 nt5.98□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 STE13YOR219C 2796 nt5.98□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 TRP5YGL026C 2124 nt5.97□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 HTZ1YOL012C 405 nt5.97□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 YPL041CYPL041C 624 nt5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.4 ms