Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD300CQ08708 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD300CQ08708 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD300CQ08708 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms