Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CXCL9Q07325 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CXCL9Q07325 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CXCL9Q07325 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms