Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 ANKRD23-205ENST00000476975 1132 ntTSL 517.38■□□□□ 0.372e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 USP7-215ENST00000566273 577 ntTSL 414.83□□□□□ -0.042e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.052e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.082e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 USP7-214ENST00000566224 503 ntTSL 313.38□□□□□ -0.272e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 WDR33-204ENST00000409658 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.342e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 WDR33-202ENST00000393006 3574 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.462e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 ZNF280B-202ENST00000619852 3981 ntTSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.792e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 USP7-212ENST00000566004 559 ntTSL 49.65□□□□□ -0.862e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 USP7-209ENST00000564117 479 ntTSL 48.29□□□□□ -1.082e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 KIAA0100-207ENST00000579253 446 ntTSL 24.94□□□□□ -1.622e-10■■■■■ 37.1
FMR1Q06787 LRRC41-205ENST00000498402 2068 ntTSL 219.98■□□□□ 0.795e-10■■■■■ 37
FMR1Q06787 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.295e-10■■■■■ 37
FMR1Q06787 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.125e-10■■■■■ 37
FMR1Q06787 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.055e-10■■■■■ 37
FMR1Q06787 LRRC41-207ENST00000617190 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.345e-10■■■■■ 37
FMR1Q06787 LRRC41-203ENST00000472710 4455 ntTSL 211.56□□□□□ -0.565e-10■■■■■ 37
FMR1Q06787 PKP4-210ENST00000480171 2772 ntTSL 29.9□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 36.7
FMR1Q06787 MCM3AP-208ENST00000494755 669 ntTSL 323.46■■□□□ 1.358e-9■■■■■ 36.6
FMR1Q06787 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.638e-8■■■■■ 36.6
FMR1Q06787 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.868e-8■■■■■ 36.6
FMR1Q06787 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.118e-8■■■■■ 36.6
FMR1Q06787 CPED1-209ENST00000520801 553 ntTSL 414.48□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 36.4
FMR1Q06787 C15orf39-206ENST00000565074 3152 ntAPPRIS ALT214.93□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 36.4
FMR1Q06787 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.052e-9■■■■■ 36.4
FMR1Q06787 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.91e-8■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.581e-8■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.091e-8■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.741e-8■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 CAPZB-209ENST00000489607 488 ntTSL 519.08■□□□□ 0.641e-8■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 CAPZB-207ENST00000459967 579 ntTSL 318.95■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 CAPZB-206ENST00000457768 432 ntTSL 315.89■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 TLN1-202ENST00000378192 1693 ntTSL 214.58□□□□□ -0.075e-11■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.158e-7■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.198e-7■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 SRCAP-203ENST00000411466 836 ntTSL 327.37■■□□□ 1.972e-9■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -11e-11■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 LINC00534-204ENST00000524361 620 ntTSL 38.1□□□□□ -1.111e-11■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.221e-11■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 LINC00534-202ENST00000523283 772 ntTSL 27.17□□□□□ -1.261e-11■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 JUP-204ENST00000420370 915 ntTSL 325.52■■□□□ 1.688e-8■■■■■ 36.3
FMR1Q06787 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.231e-11■■■■■ 36.2
FMR1Q06787 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.271e-11■■■■■ 36.2
FMR1Q06787 IL23R-204ENST00000473881 1507 ntTSL 1 (best)6.76□□□□□ -1.331e-11■■■■■ 36.2
FMR1Q06787 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.761e-11■■■■■ 36.2
FMR1Q06787 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.738e-9■■■■■ 36.2
FMR1Q06787 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.88e-9■■■■■ 36.2
FMR1Q06787 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 36.2
FMR1Q06787 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.214e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.944e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.744e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 GTF2IRD1-207ENST00000489094 2274 ntTSL 519.26■□□□□ 0.674e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.374e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.364e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 WDR76-204ENST00000478130 1172 ntTSL 316.54■□□□□ 0.244e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.144e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.014e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 MAPK8-209ENST00000429041 603 ntTSL 514.03□□□□□ -0.164e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 WDR76-202ENST00000381246 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.434e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 MAPK8-207ENST00000395611 5844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.514e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 SMG5-205ENST00000489907 535 ntTSL 310.82□□□□□ -0.684e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 MAPK8-206ENST00000374189 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.734e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 MAPK8-205ENST00000374182 5638 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.844e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 MAPK8-203ENST00000374176 5628 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best)9.42□□□□□ -0.94e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 MAPK8-204ENST00000374179 5637 ntTSL 1 (best)9.33□□□□□ -0.924e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.954e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 WDR76-201ENST00000263795 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.954e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.024e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.364e-10■■■■■ 36
FMR1Q06787 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.624e-7■■■■■ 36
FMR1Q06787 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 35.9
FMR1Q06787 ELOVL5-206ENST00000486973 794 ntTSL 316.04■□□□□ 0.163e-11■■■■■ 35.9
FMR1Q06787 ELOVL5-204ENST00000465983 696 ntTSL 315.93■□□□□ 0.143e-11■■■■■ 35.9
FMR1Q06787 ELOVL5-202ENST00000370913 580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-11■■■■■ 35.9
FMR1Q06787 ELOVL5-205ENST00000485336 761 ntTSL 513.37□□□□□ -0.273e-11■■■■■ 35.9
FMR1Q06787 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.93e-11■■■■■ 35.9
FMR1Q06787 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.923e-11■■■■■ 35.9
FMR1Q06787 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.23e-11■■■■■ 35.9
FMR1Q06787 CNOT2-206ENST00000547780 582 ntTSL 525.74■■□□□ 1.716e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-236ENST00000552231 1545 ntTSL 222.08■■□□□ 1.136e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-227ENST00000551043 2288 ntTSL 221.78■■□□□ 1.086e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-209ENST00000548159 2549 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.556e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-220ENST00000549750 1085 ntTSL 517.84■□□□□ 0.456e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-241ENST00000552915 1071 ntTSL 514.14□□□□□ -0.156e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-239ENST00000552483 895 ntTSL 513.47□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-223ENST00000550160 993 ntTSL 513.45□□□□□ -0.266e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-202ENST00000418359 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.296e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-201ENST00000229195 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.476e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-242ENST00000553020 576 ntTSL 511.47□□□□□ -0.576e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-228ENST00000551132 618 ntTSL 311.47□□□□□ -0.576e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-205ENST00000547321 577 ntTSL 211.47□□□□□ -0.576e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-207ENST00000547867 571 ntTSL 410.88□□□□□ -0.676e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-232ENST00000551661 571 ntTSL 410.46□□□□□ -0.736e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-225ENST00000550641 964 ntTSL 510.22□□□□□ -0.776e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-212ENST00000548599 643 ntTSL 59.93□□□□□ -0.826e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-234ENST00000551873 677 ntTSL 59.93□□□□□ -0.826e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-224ENST00000550194 747 ntTSL 59.93□□□□□ -0.826e-8■■■■■ 35.8
FMR1Q06787 CNOT2-208ENST00000548021 724 ntTSL 29.66□□□□□ -0.866e-8■■■■■ 35.8
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 246.8 ms