Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB3Q05901 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNB3Q05901 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB3Q05901 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms