Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRKCDQ05655 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms