Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGR4Q05215 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR4Q05215 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms