Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF85Q03923 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF85Q03923 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF85Q03923 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF85Q03923 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms