Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OC90Q02509 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OC90Q02509 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OC90Q02509 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OC90Q02509 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OC90Q02509 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OC90Q02509 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OC90Q02509 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OC90Q02509 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OC90Q02509 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OC90Q02509 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OC90Q02509 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OC90Q02509 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OC90Q02509 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OC90Q02509 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OC90Q02509 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OC90Q02509 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OC90Q02509 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OC90Q02509 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OC90Q02509 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OC90Q02509 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OC90Q02509 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OC90Q02509 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OC90Q02509 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OC90Q02509 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OC90Q02509 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OC90Q02509 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OC90Q02509 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OC90Q02509 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OC90Q02509 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OC90Q02509 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OC90Q02509 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OC90Q02509 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OC90Q02509 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OC90Q02509 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OC90Q02509 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OC90Q02509 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OC90Q02509 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OC90Q02509 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OC90Q02509 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OC90Q02509 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OC90Q02509 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OC90Q02509 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OC90Q02509 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OC90Q02509 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OC90Q02509 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OC90Q02509 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OC90Q02509 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OC90Q02509 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OC90Q02509 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OC90Q02509 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OC90Q02509 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OC90Q02509 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OC90Q02509 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OC90Q02509 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OC90Q02509 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OC90Q02509 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OC90Q02509 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OC90Q02509 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OC90Q02509 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OC90Q02509 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OC90Q02509 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OC90Q02509 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OC90Q02509 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OC90Q02509 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OC90Q02509 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OC90Q02509 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OC90Q02509 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OC90Q02509 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OC90Q02509 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OC90Q02509 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OC90Q02509 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
OC90Q02509 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OC90Q02509 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OC90Q02509 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
OC90Q02509 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OC90Q02509 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OC90Q02509 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OC90Q02509 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OC90Q02509 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OC90Q02509 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OC90Q02509 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OC90Q02509 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OC90Q02509 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OC90Q02509 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OC90Q02509 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OC90Q02509 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OC90Q02509 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OC90Q02509 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OC90Q02509 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OC90Q02509 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OC90Q02509 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OC90Q02509 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OC90Q02509 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OC90Q02509 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OC90Q02509 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OC90Q02509 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OC90Q02509 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OC90Q02509 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OC90Q02509 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms