Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPIBQ01892 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIBQ01892 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms