Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EXOSC10Q01780 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EXOSC10Q01780 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EXOSC10Q01780 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXOSC10Q01780 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms