Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MC1RQ01726 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MC1RQ01726 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms