Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXC5Q00444 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC5Q00444 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC5Q00444 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC5Q00444 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms