Protein–RNA interactions for Protein: P85037

FOXK1, Forkhead box protein K1, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK1P85037 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXK1P85037 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXK1P85037 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXK1P85037 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXK1P85037 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXK1P85037 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXK1P85037 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXK1P85037 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXK1P85037 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXK1P85037 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXK1P85037 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXK1P85037 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms