Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL7P80098 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL7P80098 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL7P80098 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL7P80098 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL7P80098 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL7P80098 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL7P80098 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL7P80098 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL7P80098 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL7P80098 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL7P80098 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL7P80098 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL7P80098 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL7P80098 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL7P80098 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL7P80098 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL7P80098 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL7P80098 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL7P80098 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL7P80098 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL7P80098 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL7P80098 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL7P80098 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL7P80098 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL7P80098 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL7P80098 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL7P80098 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL7P80098 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL7P80098 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL7P80098 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL7P80098 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL7P80098 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL7P80098 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL7P80098 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL7P80098 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL7P80098 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL7P80098 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL7P80098 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL7P80098 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCL7P80098 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL7P80098 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL7P80098 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL7P80098 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCL7P80098 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL7P80098 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL7P80098 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL7P80098 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL7P80098 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCL7P80098 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL7P80098 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL7P80098 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL7P80098 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL7P80098 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCL7P80098 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL7P80098 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL7P80098 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL7P80098 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL7P80098 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL7P80098 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL7P80098 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCL7P80098 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCL7P80098 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL7P80098 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL7P80098 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL7P80098 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL7P80098 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL7P80098 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCL7P80098 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL7P80098 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL7P80098 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL7P80098 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL7P80098 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL7P80098 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL7P80098 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL7P80098 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL7P80098 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL7P80098 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL7P80098 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL7P80098 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL7P80098 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL7P80098 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL7P80098 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL7P80098 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL7P80098 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL7P80098 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL7P80098 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL7P80098 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL7P80098 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL7P80098 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL7P80098 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL7P80098 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL7P80098 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL7P80098 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL7P80098 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL7P80098 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL7P80098 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL7P80098 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL7P80098 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL7P80098 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms