Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3EP60228 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3EP60228 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3EP60228 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms