Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
RIPK4P57078 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RIPK4P57078 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
RIPK4P57078 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RIPK4P57078 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RIPK4P57078 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RIPK4P57078 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RIPK4P57078 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RIPK4P57078 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RIPK4P57078 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RIPK4P57078 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms