Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH15P55291 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH15P55291 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH15P55291 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH15P55291 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH15P55291 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH15P55291 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH15P55291 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH15P55291 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH15P55291 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH15P55291 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH15P55291 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH15P55291 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH15P55291 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH15P55291 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH15P55291 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH15P55291 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH15P55291 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH15P55291 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH15P55291 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH15P55291 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH15P55291 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH15P55291 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH15P55291 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH15P55291 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH15P55291 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH15P55291 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH15P55291 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH15P55291 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH15P55291 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH15P55291 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH15P55291 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH15P55291 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH15P55291 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH15P55291 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH15P55291 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH15P55291 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH15P55291 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH15P55291 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH15P55291 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH15P55291 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH15P55291 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH15P55291 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH15P55291 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH15P55291 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH15P55291 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH15P55291 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH15P55291 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH15P55291 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH15P55291 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH15P55291 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH15P55291 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH15P55291 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH15P55291 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH15P55291 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH15P55291 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH15P55291 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH15P55291 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH15P55291 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH15P55291 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH15P55291 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH15P55291 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH15P55291 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH15P55291 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH15P55291 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH15P55291 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH15P55291 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH15P55291 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH15P55291 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH15P55291 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH15P55291 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH15P55291 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH15P55291 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH15P55291 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH15P55291 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH15P55291 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH15P55291 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH15P55291 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH15P55291 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH15P55291 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH15P55291 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH15P55291 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH15P55291 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH15P55291 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH15P55291 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH15P55291 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH15P55291 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH15P55291 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH15P55291 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH15P55291 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH15P55291 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH15P55291 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH15P55291 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH15P55291 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH15P55291 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH15P55291 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH15P55291 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH15P55291 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH15P55291 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH15P55291 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms