Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMP3P54852 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMP3P54852 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMP3P54852 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMP3P54852 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMP3P54852 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMP3P54852 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMP3P54852 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMP3P54852 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMP3P54852 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMP3P54852 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMP3P54852 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMP3P54852 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMP3P54852 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMP3P54852 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMP3P54852 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMP3P54852 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EMP3P54852 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMP3P54852 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMP3P54852 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMP3P54852 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMP3P54852 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMP3P54852 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMP3P54852 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMP3P54852 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMP3P54852 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMP3P54852 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMP3P54852 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMP3P54852 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EMP3P54852 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMP3P54852 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMP3P54852 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMP3P54852 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMP3P54852 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMP3P54852 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMP3P54852 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMP3P54852 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMP3P54852 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMP3P54852 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMP3P54852 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMP3P54852 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMP3P54852 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EMP3P54852 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMP3P54852 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMP3P54852 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMP3P54852 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMP3P54852 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMP3P54852 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMP3P54852 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMP3P54852 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EMP3P54852 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMP3P54852 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMP3P54852 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMP3P54852 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMP3P54852 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMP3P54852 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMP3P54852 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMP3P54852 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMP3P54852 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMP3P54852 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMP3P54852 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMP3P54852 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMP3P54852 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EMP3P54852 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMP3P54852 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMP3P54852 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMP3P54852 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMP3P54852 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMP3P54852 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMP3P54852 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMP3P54852 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMP3P54852 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMP3P54852 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMP3P54852 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMP3P54852 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMP3P54852 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMP3P54852 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMP3P54852 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMP3P54852 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMP3P54852 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMP3P54852 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EMP3P54852 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMP3P54852 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMP3P54852 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMP3P54852 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EMP3P54852 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMP3P54852 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMP3P54852 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMP3P54852 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMP3P54852 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMP3P54852 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMP3P54852 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMP3P54852 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMP3P54852 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EMP3P54852 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMP3P54852 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMP3P54852 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMP3P54852 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMP3P54852 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMP3P54852 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.4 ms