Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
EPHB3P54753 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB3P54753 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
EPHB3P54753 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms