Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD23BP54727 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD23BP54727 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms