Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA2D1P54289 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CACNA2D1P54289 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D1P54289 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms