Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP2S1P53680 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AP2S1P53680 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms