Protein–RNA interactions for Protein: P53041

PPP5C, Serine/threonine-protein phosphatase 5, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5CP53041 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP5CP53041 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP5CP53041 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPP5CP53041 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPP5CP53041 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPP5CP53041 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP5CP53041 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP5CP53041 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP5CP53041 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP5CP53041 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP5CP53041 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP5CP53041 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP5CP53041 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP5CP53041 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP5CP53041 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP5CP53041 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP5CP53041 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP5CP53041 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP5CP53041 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP5CP53041 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP5CP53041 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP5CP53041 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP5CP53041 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP5CP53041 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms