Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EFNA4P52798 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA4P52798 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFNA4P52798 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms