Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFNA3P52797 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFNA3P52797 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA3P52797 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms