Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HK3P52790 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HK3P52790 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HK3P52790 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HK3P52790 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HK3P52790 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HK3P52790 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HK3P52790 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HK3P52790 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HK3P52790 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HK3P52790 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HK3P52790 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HK3P52790 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HK3P52790 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HK3P52790 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HK3P52790 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HK3P52790 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HK3P52790 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HK3P52790 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HK3P52790 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HK3P52790 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HK3P52790 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HK3P52790 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HK3P52790 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HK3P52790 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HK3P52790 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HK3P52790 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HK3P52790 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HK3P52790 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HK3P52790 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HK3P52790 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HK3P52790 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HK3P52790 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HK3P52790 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HK3P52790 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HK3P52790 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HK3P52790 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HK3P52790 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HK3P52790 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HK3P52790 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HK3P52790 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HK3P52790 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HK3P52790 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HK3P52790 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HK3P52790 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HK3P52790 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HK3P52790 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HK3P52790 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HK3P52790 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HK3P52790 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HK3P52790 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HK3P52790 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HK3P52790 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HK3P52790 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HK3P52790 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HK3P52790 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HK3P52790 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HK3P52790 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HK3P52790 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HK3P52790 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HK3P52790 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HK3P52790 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HK3P52790 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HK3P52790 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HK3P52790 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HK3P52790 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HK3P52790 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HK3P52790 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HK3P52790 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HK3P52790 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HK3P52790 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HK3P52790 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HK3P52790 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HK3P52790 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HK3P52790 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HK3P52790 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HK3P52790 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HK3P52790 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HK3P52790 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HK3P52790 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HK3P52790 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HK3P52790 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HK3P52790 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HK3P52790 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HK3P52790 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HK3P52790 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HK3P52790 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HK3P52790 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HK3P52790 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HK3P52790 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HK3P52790 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HK3P52790 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HK3P52790 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HK3P52790 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HK3P52790 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HK3P52790 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HK3P52790 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HK3P52790 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HK3P52790 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HK3P52790 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms