Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGDP52209 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGDP52209 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGDP52209 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGDP52209 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGDP52209 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGDP52209 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGDP52209 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGDP52209 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGDP52209 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGDP52209 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGDP52209 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGDP52209 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGDP52209 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGDP52209 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGDP52209 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGDP52209 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGDP52209 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGDP52209 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGDP52209 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGDP52209 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGDP52209 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGDP52209 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGDP52209 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGDP52209 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGDP52209 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGDP52209 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGDP52209 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGDP52209 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGDP52209 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGDP52209 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGDP52209 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGDP52209 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGDP52209 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGDP52209 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGDP52209 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PGDP52209 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGDP52209 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGDP52209 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGDP52209 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGDP52209 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGDP52209 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGDP52209 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGDP52209 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGDP52209 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGDP52209 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGDP52209 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGDP52209 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGDP52209 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGDP52209 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGDP52209 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGDP52209 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PGDP52209 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGDP52209 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGDP52209 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PGDP52209 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGDP52209 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGDP52209 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGDP52209 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGDP52209 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGDP52209 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PGDP52209 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGDP52209 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGDP52209 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGDP52209 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PGDP52209 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGDP52209 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PGDP52209 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGDP52209 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PGDP52209 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PGDP52209 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGDP52209 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGDP52209 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PGDP52209 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGDP52209 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGDP52209 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGDP52209 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGDP52209 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGDP52209 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PGDP52209 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGDP52209 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PGDP52209 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGDP52209 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGDP52209 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGDP52209 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGDP52209 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGDP52209 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGDP52209 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGDP52209 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGDP52209 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGDP52209 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGDP52209 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGDP52209 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGDP52209 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGDP52209 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGDP52209 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGDP52209 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGDP52209 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PGDP52209 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGDP52209 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms